近年来,二代基因测序(next-generation sequencing,NGS)技术快速发展,其应用已进展至传染病病原学的鉴定,临床检测,如遗传疾病、实体肿瘤、血液肿瘤、感染性疾病、人类白细胞抗原分析及非侵袭性产前筛查等。如2012的H7N9病毒疫情的快速确认,四川人感染H5N6禽流感病例及江西H10N8禽流感病例的发现等二代测序技术均发挥了重要作用。
2017年,甘肃省疾控中心国家移动防疫中心建设配备美国(Life Technol Holdings Pte Ltd )的IonTorrent S5测序仪。2018年3月进行安装,调试,并开展第一次现场培训。 5月3日,负责热电的工程师再次来实验室指导病原微生物实验室全体成员等进行2017-2018年度流感病毒株的测序工作,经过多次实验及反复摸索,加班加点的工作,经过预实验,少量标本及多标本的4轮检测,于5月15日完成了省流感监测参比中心年度30株流感病毒毒株的全基因测序任务。
目前,甘肃省疾控中心病原生物实验室年轻的骨干已经初步掌握了病毒测序的整个流程,制定了流感病毒测序的SOP,测序结果分析的分析等。二代测序技术平台的建设,为我省传染病病原快速鉴定,基因序列分析,耐药基因测序,变异变迁研究奠定了基础,标志着省疾控中心传染病病原学检测能力进一步提升。(病原生物实验室)
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